海门位于江苏省东南部，东濒黄海，南倚长江，素有”江海门户”之称，与上海隔江相望，被誉为”北上海”。市境位于北纬31°46′-32°09’，东径 121°04′-121°32’。境内地势平坦，沟河纵横，地表平均海拔4.96米（以废黄河为基准）。地势呈西北略高、东南偏低，西部最高处海拔5.2 米，东部最低处海拔2.5米，南北横截面呈孤形，两头低，中间高。全市土地面积1148.77平方公里，耕地面积6.02万公顷。
公元前，长江大量泥沙沉积 于长江口，形成大小不等的沙洲，大约经过800多个春秋，至唐末，出现东洲和布洲两大洲及成群小沙洲，沙洲渐次连片。至五代后周显德五年（958）建县， 县治设于东洲镇，名海门县。海门濒江临海，屡遭风潮灾害，县境涨坍无常。尤其是明代中叶，境内大片土地坍没，坍至吕四、余东、四甲一线，县治一再迁徙，至 清康熙十一年（1672）栽县为静海乡，归并通州。清康熙四十年（1701）前后，江流回向南泓，长江北岸开始涨积，涨出40多个新沙，绵亘百余里。清乾隆三十三年（1768），建江苏省海门直隶厅，设治于茅家镇。民国元年（1912）复称海门县。1949年，新中国成立后，海门人民护坡治坍，根除坍害， 县境稳定，海门隶属于江苏省南通地区。1983年实行市管县，南通地区撤销，海门县隶于江苏省南通市。1994年6月撤县设市，成立海门市，隶于江苏省南通市，市人民政府驻地海门镇。
海门市位于万里长江入海口，素有”江海门户”之称。海门，东 濒黄海，与日本、韩国隔海相望，距长崎、釜山等国际大港仅400海里；南倚长江，与上海的直线距离仅60公里。海门，是长三角北翼联通上海的第一桥头堡， 处于承南接北的重要枢纽位置。从海门出发，200公里范围内可覆盖上海、苏州、无锡等20多个现代城市。全市土地面积1148.77平方公里。
海门市设有21个镇、1个乡、1个省级经济开发区、1个省级工业园区、2个新区、3个街道办事处、56个居民委员会、234个村民委员会（其中行政村231个、渔业村3个）。