海门区围绕“3+3”产业生态群，大力发展循环经济、绿色建筑、高技术海工船舶、工业机器人、现代家纺、精品钢、生命健康、数字通讯八条优势产业链。
1、高技术海工船舶产业链主体区镇为海门开发区和海门港新区。目前海门区的高技术海工船舶产业发展基础较强，以招商工业海门基地为龙头，去年该基地应税销售突破60亿元，随着豪华邮轮项目的快速推进，产业链将更为完善，计划到“十四五”期末，实现年应税销售200亿元。
2、工业机器人产业链主体区镇是正余镇、海门开发区、四甲镇、余东镇，特别是正余镇已经形成了以振康公司为龙头的机器人产业链，并集聚了17家关联企业，计划到“十四五”期末，该产业链实现年应税销售100亿元。
3、精品钢产业链主体区镇是海门港新区和三厂工业园区。随着千亿级中天绿色精品钢项目的竣工投产，到“十四五”期末计划实现年应税销售600亿元。
4、海门大力发展循环经济，海门将循环经济和节能减排作为落实绿色发展理念、建设生态文明的重点工作加以推进，形成以海螺新材料、俐马纺织、之禾卡纷为代表的循环经济产业集群。
5、纺织业是海门最具识别度和标志性的支柱产业、富民产业之一。如今海门拥有各类家纺生产经营主体万余家，其中企业三千多家。海门的叠石桥国际家纺城拥有2万多个店铺、带动50多万人就业，线上线下年交易总额突破1300亿元，家纺产品全国市场占有率超过60%，远销180多个国家和地区。
6、生命健康产业是海门“3+3”产业集群和“12+2”产业链的核心产业，通过十多年的发展已经形成了较为完整的产业链。近日，东布洲生命健康产业联盟揭牌成立，标志着该区生命健康产业迈入了“链式”发展、融合发展的新阶段。临江新区生物医药企业的集聚发展，加速了海门生命健康产业的高质量发展。如今，海门全区已逐步形成了涵盖药物研发、原料药、医药制剂、片剂及医用新材料、医药研发服务外包等较为完整的产业链。
7、南通海门经济技术开发区，近年来着力打造数字经济“希望田”，积极培养数字经济产业集群。持续发展信息通信产业、加快集聚集成电路产业已初见成效。园区规模较大的数字型企业，是总投资150亿元的阿里巴巴江苏云计算数据中心扩容项目。目前项目主体部分已投入运营，成为南通建设“华东主要信息港”的强力支撑，为南通打造千亿级大数据产业起到助推作用。